1.《微生物学报》微生物名词的使用：撰写论文时，要求对文章中使用的微生物学名词规范化。要严格按照全国科学技术名词审定委员会审定、公布的名词进行使用。

2.《微生物学报》文题：要求简短、醒目、准确反映主题。中文题名一般不超过30个汉字，英文题名应与中文一致。

3.《微生物学报》中英文摘要：研究论文摘要包括目的、方法、结果和结论；综述摘要包括所述领域的研究现状、作者的评论及未来展望。

4.图和表：文中的图表清晰简明，应避免图与表内容重复。图内字号为9P，所有小图的宽度应小于200px(半栏)，大图的宽度应小于425px(通栏)。图、表题应有中英文对照，图上、表内文字及图、表注释一律用英文。

5.本刊不刊登带有密级的文稿，凡投入本刊的文稿均需附本单位保密委员会的审查证明，保密责任作者自负，对于侵犯他人版权或其他权利的文稿，本刊概不承担任何连带责任。